Una vez que los pasajeros abandonaron el avión, el comandante trasladó la aeronave hacia un sector alejado, donde se le practicó la revisión de rigor con resultado negativo. Desde Aerolíneas Argentinas explicaron que el avión quedó aislado en un perímetro de 300 metros y analizado por la división explosivos. A su vez, se bajó todo el equipaje y se volvió a escanear.

Las autoridades iniciaron una investigación para determinar de dónde partió el llamado con la amenaza y detener al responsable del hecho que provocó que el vuelo 2420 aterrizara a las 22.33 en Jujuy cuando debía hacerlo a las 20.33.